制藥用水中有機(jī)物物質(zhì)一般來自于水源、水系統(tǒng)（包括凈化、貯存和輸送系統(tǒng)）以及水系統(tǒng)中菌膜的生長。總有機(jī)碳反映和代表了制藥用水中有機(jī)物質(zhì)的量。

通常將蔗糖作為理論上易氧化的有機(jī)物，按照檢查限度配置標(biāo)準(zhǔn)溶液進(jìn)行測試，在總有機(jī)碳測定儀上得出相應(yīng)的響應(yīng)值，將1,4對苯醌作為理論上難氧化的有機(jī)物，用其配制溶液進(jìn)行系統(tǒng)適用性試驗(yàn)，以考查儀器的氧化能力。

總有機(jī)碳測定方法的原理是將水中有機(jī)物質(zhì)分子完全氧化成二氧化碳（CO₂），檢測所產(chǎn)生的二氧化碳的量，然后計(jì)算出水中有機(jī)碳的濃度。制藥用水中存在無機(jī)碳和有機(jī)碳兩種形式的碳，因此測定總有機(jī)碳的方法通常有兩種：一種是從所測得的總碳（無機(jī)碳和有機(jī)碳）中減去所測得的無機(jī)碳；另一種則是在氧化過程前事先除去無機(jī)碳。

由于有機(jī)物的污染和二氧化碳的吸收都會(huì)影響測定結(jié)果的真實(shí)性。所以，測定的各個(gè)環(huán)節(jié)都應(yīng)注意避免污染。取樣時(shí)采用密閉容器，容器頂空應(yīng)盡量小。取樣后，應(yīng)馬上測試。所使用的玻璃器皿必須嚴(yán)格清除有機(jī)殘留物，并必須用總有機(jī)碳檢查用水做*后漂洗。